对于性能旗舰手机而言，良好的散热性能自然也是必不可少的。iQOO 5 Pro配备了一套超导VC液冷散热系统，并且增加了机身内部的石墨散热膜总面积，同时使用高热导凝胶对降压充电芯片进行包裹式散热，从而达到将芯片上的热量引导至均热板，实现热量有效传导的目的。

据官方的数据介绍，在游戏等重载场景下，超导碳纤VC液冷散热系统可使手机表面温度降低3.5度，CPU 温度降低12度。